Molekulārās diagnostikas metodes (GeneXpert®) nozīme multirezistentas tuberkulozes diagnostikā
Автор
Gurbo, Andrejs
Co-author
Latvijas Universitāte. Medicīnas fakultāte
Advisor
Krams, Alvils
Дата
2011Metadata
Показать полную информациюАннотации
Darba pamatojums: Latvijā ir vidēji zems tuberkulozes (TB) notifikācijas līmenis un valsts ierindojas 27 valstu grupā ar vislielāko multirezistentas TB gadījumu skaitu.
Mērķis: Izpētīt jaunievestās molekulārās diagnostikas metodes GeneXpert® (GX) jutīgumu agrīnā M. tuberculosis (MT) infekcijas un rifampicīna (RIF) rezistences atklāšanā.
Materiāli un metodes: Retrospektīvs gadījumu kontroles pētījums. Tika salīdzināti GX un bakterioloģisko izmeklējumu rezultāti pacientiem ar pirmreizēju TB, kuriem no 13/07/2010 (metodes ievešana) līdz 01/11/2010 respiratorie paraugi (krēpas un/vai bronhu skalojums) tika testēti ar GX.
Rezultāti: No 320 pacientiem, kuru 360 respiratoriskajiem paraugiem tika veikts GX tests, pirmreizējā plaušu TB tika atklāta 100 gadījumos. GX bija pozitīvs 68 gadījumos, ieskaitot 25 iztriepes negatīvus [Cīl-Nīlsena (ZN) un/vai fluorescences mikroskopija] gadījumus. Rezultāti uz šķidrās barotnes (MGIT®) bija pieejami 13, bet uz cietās barotnes (Lēvenšteina-Jensena [LJ]) - 47 dienu laikā. GX identificēja 2 iztriepēs un uzsējuma negatīvus gadījumus. MT rezistence pret RIF uz LJ barotnes tika diagnosticēta 14 gadījumos un sakrita ar MGIT® metodi 3 gadījumos (rezultāti, attiecīgi, 80 un 24 dienu laikā). 6 gadījumos no 14 (40%) GX RIF rezistences atklāšana sakrita ar LJ metodi (LJ rezultāti - 68 dienu laikā). 5 diskordanti gadījumi (GX RIF rezistents, LJ RIF jutīgs) tiek padziļināti pētīti.
Secinājumi: GeneXpert® izmantošana papildus konvencionālajām mikroskopijas metodēm uzlabo plaušu TB diagnostiku un ļauj ātrāk atklāt RIF rezistenci. Body: Latvia has middle level notification rate of tuberculosis (TB) and ranks among 27 countries with highest level of multi-drug resistant TB.
Aim: To explore the sensitivity of newly available molecular diagnostic method GeneXpert® (GX) in early detection of M. tuberculosis and rifampicin (RIF) resistance.
Methods: Retrospective case control study. 360 respiratory samples (sputum and/or bronchial washings) from 320 subjects were tested with GX from 13/07/2010 (introduction of a method) till 01/11/2010. Different respiratory samples were taken (smear, culture and GX). New pulmonary TB cases were analyzed.
Results: 100 patients had new pulmonary TB. GX was positive in 68 cases, including 25 smear negative [Ziehl-Neelsen (ZN) and/or fluorescence microscopy] cases. Results of culture on liquid media (MGIT®) were available in 13 days, but on solid Lowenstein-Jensen (LJ) media in 47. 2 patients with negative LJ culture were GX positive. Resistance of MTB against RIF on LJ media were detected in 14 cases and matched in 3 cases with MGIT® method (results available in 80 and 24 days respectively). In 6 cases out 14 (40%) when GX RIF resistance concurred with LJ method, results were available in 68 days. 5 discordant cases (GX RIF resistant, LJ RIF sensitive) currently are extensively analyzed.
Conclusions: In addition to conventional smear microscopy methods GeneXpert® improves diagnostic of pulmonary TB and allows faster detection of RIF resistance.