Multifaktoriālās dislipidēmijas un iedzimtās hiperholesterolēmijas ģenētisko riska faktoru noskaidrošana Latvijas populācijā

Abstract

Dislipidēmija ir lipīdu metabolisma saslimšana, kas ietver asins plazmas lipoproteīnu pārprodukciju vai nepietiekamību. Ir vairāki dislipidēmiju paveidi, kas atšķiras ar dažādiem lipoproteīnu profiliem. Mēs veicām 144 biežāk sastopamo, iepriekš ar dažādiem lipīdu parametriem saistītu viena nukleotīda polimorfismu genotipēšanu Latvijas populācijas paraugkopā (n = 1273) un četru ar iedzimtu hiperholesterolēmiju (IH) saistītu gēnu kodējošo rajonu jaunās paaudzes sekvenēšanu 94 Latvijas populācijas “iespējamas” IH pacientiem. Rezultāti rāda, ka polimorfismi CETP, MLXIPL un TOMM40 lokusos ir biežākie ģenētiskie faktori, kas ietekmē multifaktoriālo dislipidēmiju un funkcionālās mutācijas APOB gēnā ir biežākie IH ģenētiskie cēloņi Latvijas populācijā. Mēs arī atradām sešas jaunas variācijas APOB un LDLR gēnos, kas varētu izraisīt IH. Atslēgas vārdi: CETP, dislipidēmija, saistību analīze, NGS, APOB

Dyslipidemia is a disorder of lipid metabolism including overproduction or deficiency of lipoproteins in blood plasma. There are many types of dyslipidemia differing in presented lipoprotein patterns. We performed genotyping of 144 most common single nucleotide polymorphisms that have previously been associated with different lipid parameters in cohort of Latvian population (n = 1273) and Next Generation Sequencing (NGS) of four familial hypercholesterolemia (FH) causing gene coding regions in 94 “suspected” FH patients of Latvian population. Results show that polymorphisms in CETP, MLXIPL and TOMM40 loci are the most common genetic factors of multifactorial dyslipidemia and functional mutations in APOB gene are the most common causes of FH in Latvian population. We also found six new variations in APOB and LDLR genes that may cause FH. Key words: CETP, dyslipidemia, association studies, NGS, APOB