Baltā āboliņa Trifolium repens L. populācijas ģenētiskās daudzveidības noteikšana

Abstract

Baltais āboliņš (Trifolium repens L.) ir plaši pārstāvēts gan pilsētvidē, gan ārpus tās. Darba mērķis bija noteikt baltā āboliņa Latvijas populācijas ģenētisko daudzveidību, izmantojot iPBS (inter primer binding sites) uz retrotranspazoniem balstītu metodi, un ploiditāti, izmantojot plūsmas citometrijas metodi. Iegūtie rezultāti salīdzināti starp 3 augu paraugkopām – urbānā vide (Rīgas pilsētas teritorija), dabiskā vide (Latvijas novadu teritorijas) un selekcionētais materiāls giganteum šķirne „Daile”. Darbā analizēti 86 baltā āboliņa DNS paraugi. iPBS metodē izmantoti divi specifiski praimeri 2076 un 2079. PCR produkti analizēti 1,7% agarozes gelā. Konstatēti 107 lokusi, iegūtie rezultāti apstrādāti NTSYSpc un PopGene programmnodrošinājumos. Ar plūsmas citometrijas metodi tika noteikta baltā āboliņa ploiditāte. Pilsētvidē un ārpus tās apmēram 85% augu šūnas ir tetraploīdas, bet konstatētas tika šūnas gan ar augstāku, gan zemāku ploiditāti. Selekcionētā baltā āboliņā šķirnes „Daile” augi uzrādija augstāku ploiditāti.

White clower (Trifolium repens L.) is well represented in urban environment and wild area. The goal of this study was to determine the genetic diversity of white clover using iPBS (inter primer binding sites) on retrotranspazon based method and ploidy using flow cytometric analysis. The results were compared between 3 plant groups – sampled in the environment (Riga City area), wild area (Latvian county territory) and the variety "Daile". In the study, 86 DNA of white clover samples were. For iPBS analysis of white clover appropriate universal retrotransposon-based primers - 2076 and 2079 were chosen. The PCR products were analyzed in 1.7% agarose gelelektroforesis. Identified 107 loci. Genetic characteristics of populations were calculated by Popgene and NTSYSpc 2.1 software. Ploidy of white clover was analyzed by flow cytometry analysis. Urban environment and wild area contain about 85% of the plants cells; however, cells with higher and lower ploidy were detected. Bred white clover varieties "Daile" plants showed a higher ploidy.