Trematodes Alaria alata raksturojums dažādās infrapopulācijās Latvijā un ģints analīze, pielietojot molekulārās bioloģijas metodes

Abstract

Pētījuma mērķis bija noteikt Alaria alata sastopamību dažādās infrapopulācijās Latvijā un veikt ģints filoģenētisko koku analīzi. Pētījuma gaitā tika noteikta A. alata sastopamība meža cūkās (77%), lapsās (88%) un jenotsuņos (84%). Baltijas valstīs ekstensitāte definitīvajos saimniekos ir līdzīga. Salīdzinot divas mezocerkāriju klātbūtnes noteikšanas metodes, tika konstatēts, ka, pielietojot Alaria migrācijas metodi, mezocerkārijus konstatē 10 reizes biežāk salīdzinot ar līdz šim izmantoto metodi. Kā piemērotākais A. alata DNS izdalīšanas reaģentu komplekts tika atzīts DNeasy Blood&Tissue Kit ar palielinātu proteināzes K daudzumu (25μl) un pagarinātu inkubācijas laiku (līdz 15h). Konstruējot filoģenētiskos kokus no Gēnu bankā apkopotajām Alaria ģints sekvencēm, noskaidrots, ka Eiropā ir viena Alaria alata populācija, kurai ir kopīgs priekštecis.

The aim of this study was to determinate prevalence of Alaria alata in different infrapopulations in Latvia and to accomplish analysis of philogentic trees of the genus. Occurance of A. alata for wild boars (77%), red foxes (88%) and raccon dogs (84%) was found out during the study. Prevalence of A. alata is similar at all Baltic states. Comparing two methods of finding mesocercariae, Alaria mesocercariae migration technique is the proper method for finding mesocercariae in paratenic hosts. The best DNA extraction protocol is DNeasy Blood&Tissue Kit with an increased proteinase K volume (25μl) and incubation period (pending 15h). Construction of philogenetic trees showed that one species – Alaria alata – is found in Europe and it has common ancestor.