Vietējās kaņepju šķirnes „Pūriņi” augu ploiditātes un genotipu atšķirības molekulāro marķieru un eļļas specifisko īpašību nosakošo gēnu līmenī
Author
Latiševa, Karina
Co-author
Latvijas Universitāte. Bioloģijas fakultāte
Advisor
Grauda, Dace
Date
2015Metadata
Show full item recordAbstract
Sējas kaņepes (Cannabis sativ, L.) ir lauksaimniecībā nozīmīgs kultūraugs. Eiropas Savienības valstīs, arī Latvijā strauji pieaug interese par kaņepju audzēšanu. Pašlaik Latvijā nav savas sējas kaņepju šķirnes, kas būtu piemērotas sēklu iegūšanai. Jaunu šķirņu ātrākai iegūšanai ļoti nozīmīgas ir in vitro metodes, molekulāro metodžu izmantošana un iekļaušana selekcijas shēmā, tādēļ šim darbam ir sekojošs mērķis: vietējo kaņepju ‘Pūriņi’ in vitro kultivēšana, augu ģenētiskās daudzveidības un ploiditātes noteikšana, metilēšanas noteikšanas metodes izstrāde Δ12 un Δ15 desaturāzes gēnam.
Veicot molekulāri ģenētisko analīzi izmantojot iPBS metodi konstatēts, ka vietējās kaņepes ‘Puriņi’ populācijai ir ļoti augsta iekšējā ģenētiskā daudzveidība. Visi analizētie 76 lokusi bija polimorfi. Populācijā tika konstatēti augi ar dažādu ploiditāti: 9% diploīdi augi, 27% triploīdi (3n), 5% tetraploīdi (4n) un 59% miksoploīdi. Izmantojot SCAR metodi, konstatēts, ka analizētajā populācijā ir lielāks vīrišķo augu īpatsvars.
Metilēšanas līmenis 7 CpG saišu pozīcijas Δ12 desaturāzes gēnam analizējamos paraugos svārstās no 20% līdz 37%.
Tika noteikts, ka metilēšanas līmenis augiem no in vitro apstākļiem salīdzinājumā ar augiem, kuri izaudzēti uz lauka, ir būtiski atšķirīgs. Metilēšanas līmenis kontroles augam audzētam āra apstakļos uz lauka ir 57%. Hemp (Cannabis sativa L.) is important cultivated plant and raw material in agriculture. In the European Union, as well as in Latvia, interest towards cultivation and production of hemp is increasing. Currently Latvia has no local hemp strain that is suitable for acquiring seeds.
For rapid acquirement of new strain in vitro and molecular methods and applying them to selection scheme is very important, therefore this thesis’s goal is: in vitro cultivation of local hemp “Purini” population, determination of plant’s genetic diversity and ploidity, A12 and A15 desaturase gene methylation analysis.
While making molecular genetic analysis it was noted that local hemp “Purini” population polymorph locus number is equal to 100%. These results were obtained using iPBS method. Two primers were used for the analysis and 76 loci were analyzed in total.
Diploidity (2n) was determined in 9% of samples, triploidity (3n) was determined in 27% of samples, tetraploidity was determined in 5% of samples and mixoploidity was determined in 59% of samples.
SCAR method was used for determination of sex of hemp on early stages. Methylation level of samples, grown in the same in vitro conditions, varies from 20% to 37%.
There are differences between methylation levels in the samples, cultivated in vitro and samples from control group of hemp. Methylation level of plants grown in soil is 57%.