Impact of various factors on the diversity of soil microorganisms in agricultural and forest soils
Author
Grantiņa-Ieviņa, Lelde
Co-author
Latvijas Universitāte. Bioloģijas fakultāte
Advisor
Nikolajeva, Vizma
Date
2014Metadata
Show full item recordAbstract
Darba mērķis bija raksturot augsnes saprofītisko baktēriju un micēlijsēņu populācijas mērenā klimata augsnēs, izvirzot hipotēzi, ka augsnes mikroorganismu populāciju struktūra un daudzveidība ir atšķirīga dažādos zemes lietošanas veidos un
sezonāli mainīgos klimatiskajos apstākļos, un ka vairākas analīžu metodes dod
salīdzināmus rezultātus. Pirmkārt, augsnes saprofītisko micēlijsēņu un baktēriju
populāciju kvantitatīvā analīze tika veikta, izmantojot klasiskās mikrobioloģijas
metodes, t.i., mikroorganismu koloniju veidojošo vienību skaita noteikšana;
mikroskopisko micēlijsēņu izolēšana, identifikācija un daudzveidības noteikšana.
Otrkārt, tika izmantotas molekulārās bioloģijas metodes - baktēriju un sēņu
daudzveidības noteikšana ar amplificētās rDNS restrikcijas analīzi; qPCR; sēņu
tīrkultūru identifikācija, izmantojot rDNS ITS1-5.8S-ITS2 reģionu. Treškārt, tika
noteiktas Penicillium ģints izolātu antagonistiskās īpašības pret Heterobasidion
annosum izolātiem in vitro. The aim of study was to characterize populations of soil bacteria and fungi in
temperate climate soils. A hypothesis was proposed that soil microbial population
structure and diversity is different in various land use types and in seasonally
changing conditions, and that several methods give comparable results.
First, quantitative analysis of populations of saprophytic soil fungi and bacteria
were performed using classical microbiology methods, i.e., enumeration of microbial
colony-forming units; isolation, identification and estimation of diversity of
filamentous fungi. Second, methods of molecular biology were used, i.e., estimation
of bacterial and fungal diversity with amplified rDNA restriction analysis; qPCR;
identification of fungal isolates using sequencing of rDNA region ITS1-5.8S-ITS2.
Third, antagonistic properties of isolates from Penicillium genus against
Heterobasidion annosum isolates in vitro were measured.