Ekstracelulārās vezikulās ietvertās mikrobiālās RNS atklāšana cilvēku asins un urīna paraugos

Abstract

Gandrīz visi cilvēka šūnu tipi sekretē ekstracelulārās vezikulas (EVs), un tām ir svarīga loma starpšūnu komunikācijā. Jaunākie pētījumi liecina, ka komunikācija notiek arī starp cilvēka mikrobiotu un saimniekorganisma šūnām. Šajā pētījumā mēs parādām, ka no cilvēka asinīm un urīna izdalītās EVs satur RNS fragmentus no dažādiem mikroorganismiem. Visbiežāk sastopami baktēriju tipi un supertipi asinīs un urīnā bija Proteobacteria, PVC grupa un Terrabacteria. Lai noteiktu vai šo mikrobiālo transkriptu galvenais avots ir zarnu mikrobioms, mēs izstrādājām EV izdalīšanas metodi no cilvēku fēču paraugiem. Tālāk mēs plānojām veikt RNS sekvencēšanas (RNA-seq) analīzi EV, kas izdalītas no plazmas, urīna un fēcēm no tiem pašiem indivīdiem.

According to numerous studies, extracellular vesicles (EVs) are released by almost all cell types within human body and act as mediators of various biological processes via cell-to-cell communication. Recent studies show that intercellular communication is possible between human microbiota and host cells as well. In this study, we show that EVs isolated from human blood and urine contain RNA fragments derived from various microorganisms. The most commonly represented phyla and superphyla in blood and urine were Proteobacteria, PVC group and Terrabacteria. To determine if the major source of these microbial transcripts is gut microbiome, we developed a method for the isolation of EVs from human stool samples. Next, we plan to perform RNA sequencing (RNA-seq) analysis of EVs isolated from plasma, urine and stool from the same individuals.