Vairogdziedzera autoimūno patoloģiju ietekmējošie ģenētiskie faktori Latvijas populācijā

Abstract

Eiropā, tostarp Latvijā, pieaug saslimstība ar vairogdziedzera autoimūnām slimībām, Greivsa slimību (GS) un Hašimoto tireoidītu (HT). Tika izvēlēti 9 gēni un to polimorfismi-IL10 (rs1800871, rs1800872, rs1800896), TNFA (rs1800629, rs361525), IL6 (rs1800795), CTLA4 (rs3087243), IL1 (rs1143643), ARID5B (rs6479778), NRXN3 (rs12147587), TSHR (rs2284720), TGFB1 (rs1800469, rs1800470)-lai noskaidrotu vai šie polimorfismi asociējas ar GS/HT Latvijas populācijā. Rezultāti: retāk izplatīto alēļu frekvences (rs1800896-G, rs1800795-G, rs3087243-A, rs1143643-T, rs6479778-T, rs1800469-A, rs1800470-G) septiņos gadījumos AITD pacientiem ir zemākas nekā kontroles grupai, bet pārējos sešos (rs1800871-T, rs1800872-A, rs1800629-A, rs361525-A, rs12147587-T, rs1184720-G)- pārsniedz kontroles grupas rādītājus. Statistiski būtiska asociācija ar GS iegūta rs1800629 un rs3087243. Secinājumi: Starp pētāmajiem polimorfismiem rs1800629 un rs3087243 alēļu frekvences būtiski atšķīrās pacientu un kontroles grupās.

In Europe, including Latvia, the incidence of thyroid autoimmune diseases, including Graves` disease (GD) and Hashimoto thyroiditis (HT), is growing. We chose 9 genes and their polymorphisms -IL10 (rs1800871, rs1800872, rs1800896), TNFA (rs1800629, rs361525), IL6 (rs1800795), CTLA4 (rs3087243), IL1 (rs1143643), ARID5B (rs6479778), NRXN3 (rs12147587), TSHR (rs2284720), TGFB1 (rs1800469, rs1800470) to find out if these polymorphisms are associated with AITD in Latvian population. We found that frequencies of seven rare alleles (rs1800896-G, rs1800795-G, rs3087243-A, rs1143643-T, rs6479778-T, rs1800469-A, rs1800470-G) are lower in AITD patients than in the control group, but for other six polymorphisms (rs1800871-T, rs1800872-A, rs1800629-A, rs361525-A, rs12147587-T, rs1184720-G)- higher. Results suggest that rs1800629 and rs3087243 are statistically significantly associated with GD. Conclusions: SNPs in genes TNFA (rs1800629) un CTLA4 (rs3087243) are associated with susceptibility to GD