MtDNS mutāciju, kas ir saistītas ar antibiotiķu inducētu nesindromisku kurlumu, noteikšana etnisku latviešu populācijā

Abstract

Šajā darbā ir aplūkota cilvēku mitohondriālā genoma 12S rRNS kodējošā gēna (MT-RNR1) polimorfismu izplatība etnisku latviešu populācijā. Vismaz sešas šī gēna mutācijas – A1555G, C1494T, T1095C, T961G, 961insC(n) un A827G – tiek asociētas ar paaugstinātu ototoksicitātes risku, lietojot aminoglikozīdu klases antibiotikas. Mutāciju noteikšanai 12S rRNS gēna fragmenti tika sekvenēti 191 etnisko latviešu mtDNS paraugam. Rezultātā 14 no tiem tika identificēta kāda no mitohondriālajām mutācijām, to skaitā četri patogēnie varianti, starp kuriem vienam tika konstatēta saistība ar mtDNS H11a haplogrupu, un divi jauni varianti, G951A un T961A, kuru loma ototoksicitātes patoģenēzē vēl ir neskaidra. Iegūtie rezultāti liecina, ka 5,8% etnisko latviešu populācijas varētu būt pakļauti paaugstinātam ototoksicitātes riskam aminoglikozīdu lietošanas laikā, norādot uz nepieciešamību pacientiem veikt ģenētisko skrīningu pirms terapijas uzsākšanas.

This study describes the prevalence of polimorphisms of the human mitochondrial DNA 12S rRNA coding gene (MT-RNR1) among ethnic Latvian population. At least six polymorphisms of this gene - A1555G, C1494T, T1095C, T961G, 961insC(n) and A827G - were associated with aminoglycide induced ototoxicty in whorldwide studies. In this study, 191 ethnic Latvian DNA samples were used. For mutation detection the fragments of mtDNA 12S rRNA gene were sequenced. The results of this study showed that 14 samples carried a mitochondrial mutation, including four pathogenic variants, among which one is related to the H11a mtDNA haplogroup, and two novel variants (G951A and T961A), whose association with ototoxicity risk is still unknown. In total, approximately 5.8% of ethnic Latvians could be exposed to the elevated ototoxicity risk, revealing the need for patients’ genetic screening before aminoglycoside terapy.