Saimniekorganisma miRNS loma zarnu mikrobioma kompozīcijas izmaiņās diētas ar paaugstinātu tauku saturu ierosinātā 2. tipa cukura diabēta peļu modelī metformīna terapijas kontekstā

Abstract

Otrā tipa cukura diabēta ārstēšanai visplašāk izmantotais medikaments ir metformīns. Cilvēkiem, kas lieto metformīnu ir novērotas blakusparādības, kuru cēlonis, iespējams, ir saistīts ar zarnu mikrobioma izmaiņām. Lai noskaidrotu, vai fekālās miRNS korelē ar zarnu mikrobiomu, paraugi tika sekvenēti, izmantojot Small RNA-seq metodi. MiR-29 saimes pārstāvji pozitīvi korelēja ar Clostridia ģints baktērijām un negatīvi korelēja ar Bacteroides un Bacilli. Mmu-miR-30a-5p parādīja lielāko pozitīvo korelāciju ar Firmicutes un Proteus mirabilis, negatīvo – ar Bacteroides baktērijām. Netika novērotas metformīna ierosinātas miRNS izmaiņas. Atslēgas vārdi: otrā tipa cukura diabēts, metformīns, miRNS, zarnu mikrobioms, peļu modelis.

Metformin is commonly used for treatment of type 2 diabetes mellitus. Patients report of having side effects, which might be associated with changes in gut microbiome. To determine how fecal miRNAs correlate with gut microbiome, samples were sequenced using Small RNA sequencing. MiR-29 family members positively correlated with Clostridia and negatively correlated with Bacteroides and Bacilli. Mmu-miR-30a-5p showed the strongest positive correlation with Firmicutes and Proteus mirabilis, and negative correlation with Bacteroides. No significant effect of metformin treatment on miRNA abundance was observed. Keywords: type 2 diabetes mellitus, metformin, miRNA, microbiome, mouse model.