Saimniekorganisma miRNS un zarnu mikrobioma mijiedarbība dažādos kolonoskopijas izmeklējumu paraugos

Abstract

Cilvēka gastrointestinālajā traktā ir daudzveidīgs mikrobioms, kam ir būtiska loma veselības uzturēšanā un fizioloģisko funkciju veikšanā organismā. Mikrobioma traucējumi ietekmē imūnsistēmas funkcijas, vielmaiņu, kā arī saistīti ar dažādām slimībām. MikroRNS (miRNS) ir nozīmīga loma gēnu ekspresijas regulēšanā. Pētījumos noskaidrots, ka saimniekorganisma miRNS tieši ietekmē zarnu mikrobiomu, tādējādi potenciāli nodrošinot daudzsološu stratēģiju, lai mērķtiecīgi modificētu mikrobiomu. Lai noskaidrotu, vai pacientu, kuriem dažādu iemeslu dēļ ir veikta kolonoskopija, zarnu biopsiju miRNS korelē ar fēču mikrobiomu veikta mazo RNS un metagenoma sekvencēšana. MiR200, miR-151, miR-30 saimes pozitīvi korelē ar Tannerellaceae un Lachnospiraceae dzimtas pārstāvjiem. Hsa-miR-99a-5p, hsa-miR-146b-5p miRNS pozitīvi korelē ar Actinomycetaceae un Oscillospiraceae dzimtas pārstāvjiem.

The human gastrointestinal tract contains a diverse microbiome that has a fundamental role in maintaining health and performing important physiological functions in the human body. Microbiome disruption affects the immune function, metabolism, and is involved in several diseases. MicroRNAs (miRNA) have an important role in the regulation of gene expression. Studies have shown that miRNAs of the host have a direct impact on gut microbiome, thus potentially providing a promising strategy to modify the microbiome in a targeted fashion. To determine whether there is a correlation between intestinal biopsy miRNAs and the gut microbiome composition, small RNA and metagenome sequencing were performed. MiR-200, miR-151, miR-30 family members positively correlated with Tannerellaceae and Lachnospiraceae family members. Hsa-miR-99a-5p, hsa-miR-146b-5p miRNS positively correlated with Actinomycetaceae un Oscillospiraceae dzimtas pārstāvjiem.