Tetrazīna fragmentu saturošu linkeru sintēze proteīnu modificēšanai
Zusammenfassung
Maģistra darbā ir veikta jaunu, alifātisku un PEG fragmentus saturošu, tetrazīna linkeru sintēze proteīnu biokonjugācijai. Darba ietvaros iegūti un izolēti 3 linkeri, kas paredzēti neselektīvai Lys aminoskābju atlikumu modificēšanai, un arī iegūti vēl 3 linkeri, kas paredzēti reģiospecifiskai proteīna N-gala modificēšanai. Darba ietvaros arī izolēts viens linkeris, kas paredzēts His modificēšanai. Visi sintezētie linkeri tika testēti modificējot Borrelia Burgdorferi MlpC lipoproteīnu, kā arī veikta paraugu MALDI-TOF MS analīze, kurā no septiņiem linkeriem, seši ir uzrādījuši konjugāta veidošanos ar MlpC. Masters thesis is dedicated to synthesis of new linkers containing tetrazine handle, PEG and aliphatic chain spacers. The thesis contains methods of obtaining tetrazine and PEG linkers for regiospecific modification of protein N-terminus. We have developed 3 linkers for non-specific Lys side chain modifications, 3 linkers for regiospecific modification of N terminus and 1 for His side chain modification. All of the synthesized linkers were tested using Borrelia Burgdorferi MlpC lipoprotein. Obtained data suggests that six out of seven linkers show formation of conjugates with protein of interest.