Audzēja šūnu selektīva aptamēra internalizēšanās šūnā raksturošana

Abstract

Aptamēri ir vienas virknes DNS vai RNS oligonukleotīdi, kas savas specifiskās uzbūves dēļ ar augstu afinitāti spēj saistieties pie dažāda veida proteīniem. Aptamēru pielietojums ir plašs – tos var izmantot gan diagnostikā, gan slimību, piemēram, vēža ārstēšanā. Šī darba mērķis bija ar attēlveidojošās plūsmas citometrijas un konfokālās mikroskopijas palīdzību noskaidrot, kā dažādi aptamēra inkubācijas apstākļi ietekmē Seq36 internalizēšanos šūnā. Pētījumā tika konstatēts, ka aptamērs Seq36 internalizējas kodolā tikai pie šūnu iepriekšējas fiksācijas un permeabilizācijas, kamēr dzīvās šūnās Seq36 vairāk saistījies ar citoplazmas un šūnas membrānas proteīniem.

Aptamers are single-stranded DNA or RNA oligonucleoids which, due to their specific structure, are able to bind to different types of proteins with very high affinity. Aptamers are widely used – in both diagnostics and in treatment of many diseases, for example, cancer. The purpose of this study was using imaging flow cytomometry and confocal microscopy determine, how different aptamer incubation conditions affect Seq36 internalisation in the cell. It was found that the aptamer binds to the nucleus of the cell only prior to fixation and permeabilisation, while in live cells Seq36 mostly binds to cytoplam and cell membrane proteins.