Izmaiņas stacionētu COVID-19 pacientu asins šūnu gēnu ekspresijas un seruma metaboloma profilos

Abstract

COVID-19 pandēmija turpina būt lielākais globālais drauds sabiedrības veselībai, sasniedzot ne tikai apjomīgus infekcijas gadījumu skaitus, bet arī salīdzinoši augstu mirstību starp tiem (~2%). COVID-19 raksturīga heterogēna slimības gaita un šobrīd nav atrasti medikamenti, kas novērš smaga un kritiska stāvokļa iestāšanos. Lai noskaidrotu kādi mehānismi iesaistīti stacionētu COVID-19 pacientu patoģenēzē, tika veikta mērķēta metaboloma un transkriptoma analīze divos laika punktos: pacientam iestājoties slimnīcā un aptuveni 30 dienas vēlāk, tādejādi salīdzinot akūtās fāzes paraugus pret atveseļošanās fāzi. Rezultāti liecina par spēcīgām izmaiņām vairākos metabolajos un imūnsistēmas signālceļos, tai skaitā par pastriprinātu triptofāna katabolismu kinureīna ceļā, komplementa sistēmas aktivāciju un neitrofilu tīklu veidošanos.

COVID-19 pandemic continues to be the greatest global threat to public health, reaching not only high infection rate, but also relatively high case-fatality rate (~2%). COVID-19 is heterogeneous disease in terms of symptom severity and range of organs the disease can affect. To find out what mechanisms are involved in the pathogenesis of hospitalised COVID-19 patients quantitative metabolome and whole blood transcriptome analysis was performed at two time points: at the acute phase (time of admission in hospital) and at recovery phase (approximately 30 days later). The results suggest strong changes in metabolic and immune system signaling pathways, among them enhanced tryptophan catabolism in kynurine pathway, activation of blood complement systems and the neutrophil extracellular trap formation. Key words: COVID-19, SARS-CoV-2, transcriptome, metabolome. The title of this work: ‘’Alterations in blood sera metabolome and blood transcriptome in hospitalized COVID-19 patients.’’