Borrelia Burgdorferi ārējās virsmas proteīnu BB0689 un BBA73 molekulārie pētījumi

Abstract

Darbs veidots ar mērķi noskaidrot B. burgdorferi ārējās virsmas proteīnu BB0689 un BBA73 iespējamo lomu Laimboreliozes patoģenēzē. Eksperimentāli noteikti šo proteīnu potenciālie mijiedarbības partneri izmantojot uz Ni 2+ afinitātes hromatogrāfijas balstītu pulldown metodi, kā arī apkopoti literatūras dati par šo proteīnu nozīmīgumu zīdītāju infekcijas izraisīšanas procesā. Proteīnu mijiedarbības partneri identificēti ar masas spektrometrijas analīzi. Darbā apkopota informācija par alternatīvām proteīnu-proteīnu mijiedarbības pētījumu metodēm, kā arī par līdz šim raksturotajiem Borēliju ārējās virsmas proteīniem. Pētījumā iegūtie rezultāti iesniegti prezentēšanai FEBS 2013. gada kongresā. Atslēgvārdi: Borrelia burgdorferi, BB0689, BBA73, pulldown, ārējās virsmas proteīni, masas spektrometirjaSUMMARY The aim of this study is to investigate potential role of Borrelia burgdorferi sensu lato outer surface proteins involved in Lyme disease pathogenesis. Experimental data was obtained by preforming Ni 2+ chromatography based pulldown assay. Also recently described information about BB0689 and BBA73 involment in development of persistent infection in mammalian organism. Protein potentional interaction partners were identified using Mass spectrometry. Summarizing description about commonly used protein-protein interaction assays and brief information about some described outer surface proteins is also included. Results have been submitted to FEBS congress 2013. Keywords: Borrelia burgdorferi, BB0689, BBA73, pulldown, Outer surface proteins, Mass spectrometry