Pārmantoto neiromuskulāro slimību molekulārie pamati

Abstract

Muskuļu distrofijas ir pagaidām neārstējamas deģeneratīvas muskuļu slimības, kuras izraisa mutācijas muskuļiem-specifiskus proteīnus vai enzīmus kodējošajos gēnos. Maģistra darba mērķis ir uzlabot neiromuskulāro slimību diagnostikas iespējas Latvijā, izveidot slimību noteikšanas algoritmu, ja iespējams, nodrošināt esošo pacientu precīzas diagnozes noteikšanu. Darba izstrādē svarīgākās izmantotās molekulārās bioloģijas metodes ir vairāku veidu sekvenēšana un imunohistoķīmiskās analīzes. Tika izanalizēti kopumā 282 personu DNS paraugi, veikta pilna gēna CAV3, gēnu CAPN3, FKRP un ANO5 noteiktu lokusu tiešā sekvenēšana, pilna eksoma sekvenēšana un izvēlēta gēnu paneļa sekvenēšana. Izveidotais algoritms ir apmierinošs, bet tam nepieciešami uzlabojumi. Iegūtie dati izmantoti pacientu diagnozes apstiprināšanai.

Muscle dystrophies are for the time being untreatable degenerative muscle diseases, that are caused by mutations in genes coding muscle-specific proteins or enzymes. The goal of this master’s thesis was to improve diagnostic possibilities for patients with neuromuscular disorders in Latvia, create algorithm of disease diagnostics, as well as provide specific diagnosis for existing patients. Most important molecular biology methods used in this work are several sequencing approaches and immunohistochemistry. DNA samples from 282 persons were analyzed. Direct sequencing of gene CAV3 and selected regions of genes CAPN3, FKRP and ANO5, full exome sequencing and sequencing of chosen gene panel was performed. The created algorithm is satisfactory, but some improvements are necessary. Collected data were used to confirm patient diagnoses.