Mikrolodīšu un mikrorindu kā multipleksu seruma autoantivielu detekcijas sistēmu tehnisko parametru salīdzinājums

Abstract

Vēzis ir plaši izplatīta slimība, kura ārstēšana ir bieži nesekmīga dēļ vēlīnas diagnostikas. Daudzsološi biomarķieri jauna agrīnas diagnostikas testa izstrādei ir autoantivielas, ko detektē pacientu serumā pret audzēju antigēniem. Lai tās analizētu, ir nepieciešams izstrādāt jūtīgu, augstas caurlaidspējas tehniku. Šī darba mērķis bija noteikt, kura proteīnu ekspresijas sistēma un kura no divām tehnoloģiskajām platformām - mikrosfēras vai mikrorindas, ir piemērotākā audzēju autoantivielu detektēšanai, salīdzinot dažādus tehniskos parametrus: atkārtojamību, jutību, dinamisko diapazonu u.c. Iegūtie rezultāti parādija, ka E. coli sniedz augstāku proteīna iznākumu par bezšūnu ekspresijas sistēmu, un ka mikrorindas ir piemērotākas par mikrolodītēm, jo tām ir augstāka jutība.

Cancer is a widespread disease, its treatment is often unsuccessful because of late diagnosis. Autoantibodies against cancer antigens are promising biomarkers for the development of early cancer diagnosis test. For the analysis of autoantibodies, it is necessary to develop a sensitive, high-throughput technique. The objective of this work was to determine which protein expression system and which of the two technological platforms - microspheres or microarrays, are best suited for tumor autoantibody detection by comparing different technical parameters: reproducibility, sensitivity, dynamic range, etc. The results showed that E. coli cellular expression system gives a higher yield of proteins than cell free protein expression system and that microarrays are more suited than microspheres because of higher sensitivity.