Cilvēka 14.hromosomas proteasomu gēnu klastera polimorfismi un to asociācija ar autoimūnām un metaboliskām slimībām Latvijas populācijā

Abstract

Tika izpētīta 14q11.2 - 14q23 hromosomas reģiona proteasomu gēnu klastera ģenētiskā daudzveidība Latvijas (LV), Lietuvas (LT) un Taivānas (TW) populācijās. Novērotas atšķirības PSMA6 un PSMC6 gēnu variāciju sadalē. Noteikta asociācija starp pētāmo gēnu polimorfismiem un bērnu astmu LV un TW iedzīvotājiem. PSMC6 un PSMA3 variācijas veicina uzņēmību pret JIA, tās var uzskatīt par riska faktoriem, kas ir atkarīgi no JIA apakštipiem un no dzimuma. PSMB5 un PSMC6 gēnu polimorfismu variācijas izrādījās asociētas ar aptaukošanos kā ģimenes un dzimumu specifiskie riska faktori. Tika pieradīta PSMA6 / PSMC6 / PSMA3 gēnu kombinācijas dzimumam specifiska asociācija starp JIA apakštipiem un proteasomu koncentrāciju asins plazmā. Pēc in silico analīzes datiem pētāmo polimorfismu varianti var mainīt transkripcijas faktoru piesaistīšanās vietas un mikroRNS sastāvu, tas var būtiski modulēt saistīto gēnu transkripciju un rezultātā – ietekmēt uzņēmību pret slimībām.

The genetic diversity of proteasome genes located in 14q11.2 - 14q23 chromosomal region was investigated in Latvian (LV), Lithuanian (LT) and Taiwanese (TW) populations. Significant differences were revealed in distribution of PSMA6 and PSMC6 genes variations. Our results suggest an association of the investigated polymorphisms with bronchial asthma in LV and TW. Variations at the PSMA6, PSMC6 and PSMA3 genes contribute to JIA subtype- and sex-specific susceptibility. Variations at the PSMB5 and PSMC6 genes could be suggested as OB familial and sex-specific risk factors. The sex-specific association of PSMA6/PSMC6/PSMA3 genetic variants with subtypes of JIA and plasma proteasome concentrations was revealed. In silico analysis reveals that the studied nucleotide substitutions modify transcription factor binding sites and miRNAs, this can significantly modulate the transcription of related genes and influence the diseases susceptibility.