Gēnu ekspresija glioblastomas pacientiem ar atšķirīgu dzīvildzi

Abstract

Glioblastomu raksturošana molekulārā līmenī ar gēnu ekspresijas mikročipiem ir aktuāla metode mūsdienās, lai identificētu jaunus pretvēža terapijas mērķus. Darba mērķis bija salīdzināt divas pacientu grupas ar atšķirīgu dzīvildzi un noteikt atšķirīgi ekspresētos gēnus. Gēnu ekspresijas analīzi veica ar mikročipu tehnoloģiju, salīdzinot divas grupas. Negatīvā grupā sastāvēja no 13 pacientiem, kam dzīvildze bija īsāka par 6 mēnešiem, un pozitīvā - 15 pacienti ar dzīvildzi virs 6 mēnešiem. Glioblastomu RNS tika izdalīts no formalīnā fiksētiem, parafīnā guldītiem audiem. Iegūtos datus apstrādāja, izmantojot statistiskās analīzes metodes. Rezultātā noteica 30 dažādi ekspresēti gēni, no kuriem izdevās sagrupēt 18 gēnus pēc to iespējamām funkcijām vēža šūnā. Iegūtie rezultāti neuzrādīja būtiskas atšķirības starp abām pacientu grupām (r2=0.9575).

Glioblastoma characterization in molecular level using gene expression microarrays nowadays is wildly used to identify new anti-cancer therapy targets. The aim of our study was to compare 2 pacient groups with different lifespan and to determine differentlly expressed genes. Gene expression analysis was made using microarray technology by comparing samples from 2 groups. Negative group consisted of 13 patients who had lifespan below 6 months, and positive group- 15 patients with lifespan above 6 months. Glioblastoma RNA was extracted from paraffin embedded tissue. Acquired data was processed using statistical analytical methods. Results showed 30 differentially expressed genes 18 of which were grouped according to there functions in cancer cells. Acquired data did not show significant differencies between 2 pacient groups (r2=0.9575).