Latgales reģionā cirkulējošo Mycobacterium tuberculosis genotipu raksturojums

Abstract

Tuberkuloze ir pasaulē izplatīta infekcijas slimība, kuras izraisītājas ir M. tuberculosis kompleksā ietilpstošās mikobaktērijas. Darbs tika veikts, lai noteiktu un raksturotu Latgales reģionā cirkulējošo M. tuberculosis genotipus. Darbā ir izmantotas molekulāras genotipēšanas metodes: starpfragmentu oligonukleotīdu genotipēšanas metode, kas ir balstīta uz polimerāzes ķēdes reakciju un tiešā atkārtojuma (DR) reģiona amplificēšanu; restrikcijas fragmentu garuma polimorfisma analīzes metode, kur M. tuberculosis genotips tiek noteikts pēc insercijas sekvenču IS6110 kopiju skaita un izvietojuma atšķirībām hromosomā. Rezultātos tiek atspoguļots, kādas līnijas un apakšlīnijas atrastas Latgales reģionā, kā arī salīdzināti iegūtie spoligotipi ar Latvijas un kaimiņvalstu populācijā identificētim.

Tuberculosis is a world-wide infectious disease caused by mycobacterias belonging to the M. tuberculosis complex. Work was carried out to identify and describe the circulating genotype of M. tuberculosis in Latgale region. The work is based on using two molecular genotyping techniques: spacer oligonucleotide typing method based on polymerase chain reaction and amplification of the DR region; restrition fragment-length polymorphism method where the M. tuberculosis genotype is determined by differences in the number and placement of the number of copies in IS6110 insertion region of chromosome. The results reflect what lineages and sub-lineages were found in Latgale region, as well as spoligotypes comparison with Latvian and neighbour countries population.