Prostatas vēža pacientu audzēju un bioloģiskos šķidrumos atrodamo ārpusšūnas vezikulu transkriptomu salīdzinājums

Abstract

Visdažādāko veidu šūnas izdala ārpusšūnas vezikulas (EVs) un ir pierādīts, ka tām ir nozīmīga loma prostatas vēža (PCa) attīstībā, jo tās spēj pārnest dažādas bioloģiskās molekulas, tostarp RNS, no vienas šūnas uz otru. Šis darbs ir vērsts uz plazmas un urīna EV, kā arī PCa audzēja un normālu prostatas audu transkriptoma izpēti, izmantojot RNS sekvencēšanas (RNA-seq) tehnoloģiju. Rezultāti uzrādīja, ka 1868 proteīnus kodējošie gēni un 1108 garās nekodējošās RNS (lncRNS) bija paaugstināti ekspresētas audzēja audos salīdzinājumā ar normāliem prostatas audiem, taču tikai 6% līdz 31% proteīnus kodējošie gēni un 1% līdz 5% lncRNS bija atrodamas EVs, kas liecina, ka EV ietvertā RNS saturs tikai daļēji atspoguļo audzēja saturu. Neskatoties uz to, PCa pacientu plazmas un urīna EVs saturēja RNS, kas nākušas no PCa audzēja.

Extracellular vesicles (EVs) are released by various types of cells and are shown to play a role in prostate cancer (PCa) development by transferring a variety of biological molecules, including RNAs from one cell to another. This work focuses on analyzing the transcriptome of plasma and urinary EVs and matched tumor and normal prostate tissues by using RNA sequencing (RNA-seq) technology. Results showed that in total 1868 protein-coding genes and 1108 long non-coding RNAs (lncRNA) were overexpressed in tumor tissues versus normal tissues. However, only 6% to 31% of overexpressed protein-coding genes and 1% to 5% of overexpressed lncRNAs were present in EVs, suggesting that EV-enclosed RNA content only partially reflects the tumor content. Nevertheless, PCa patient plasma and urinary EVs did contain a fraction of PCa-derived RNAs.