Anaerobās mikrobiotas kultivēšana un analīze, pielietojot zarnas uz čipa bez PDMS polimēra

Abstract

Ir pierādīts, ka zarnu mikrobiota korelē ar vēža attīstību, kas iespējams notiek pateicoties baktēriju ārpusšūnu vezikulām (BEV). Taču šobrīd cilvēka mikrobiotas komunikācijas mehānismu izpēta ar saimniekorganimsa šūnām ir komplicēta. Kā viena no perspektīvākām in vitro testa sistēmām šo metožu petīšanai ir zarnas uz čipa (GOC) modeļsistēmas. Līdz ar to šī darba mērķis ir izveidot GOC modeli, kas ļautu kultivēt anaerobu cilvēka zarnu mikrobiotu izdalītu no fēču parauga. Darba laikā tika izveidots inovatīvs GOC modelis, lai kultivētu un analizētu cilvēka anaerobu mikrobiotu un to BEV. Pēc rezultātiem tika secināts, ka ir izdevies izdalīt anaerobu mikrobiotu un ka jaunizveidotie GOC ir pielietojami anaerobas mikrobiotas BEV pētījumiem. Atslēgas vārdi: zarnas uz čipa, zarnu mikrobiota, baktēriju ārpusšūnu vezikulas, kanceroģenēze

Intestinal microbiota has been shown to correlate with cancer development, possibly due to bacterial extracellular vesicles (BEV). However, the study of the mechanism of human microbiota communication with host cells is currently complicated. One of the promising in vitro test systems for researching these methods is the gut on chip (GOC) model system. Therefore, the aim of this work is to develop a GOC model that would allow the cultivation of anaerobic human intestinal microbiota isolated from a faecal sample. During the work, an innovative GOC model was developed to cultivate and analyze human anaerobic microbiota and their BEV. The results showed that the anaerobic microbiota was isolated and that the newly developed GOC were applicable to the BEV studies of the anaerobic microbiota. Keywords: gut on chip, intestinal microbiota, bacterial extracellular vesicles, cancerogenesis