NO LATVIJAS NOTEKŪDEŅIEM JAUNIZDALĪTO AEROMONAS SALMONICIDA BAKTERIOFĀGU RAKSTUROŠANA

Abstract

Darbā aprakstīta no Jelgavas pilsētas notekūdeņiem izolētas un pēc 16S rRNS gēna sekvenēšanas identificētas baktērijas Aeromonas salmonicida subsp. salmonicida celma JK jaunizdalīto bakteriofāgu raksturošana. Īpaša uzmanība tiek pievērsta no tās pašas pilsētas notekūdeņu parauga izolētam Aeromonas fāgam JELG-KS1, kas potenciāli reprezentē ne tikai jaunu fāgu sugu, bet arī ģinti. Izvelētā fāga padziļinātai raksturošanai tika veikta fāga dzīvescikla, morfoloģijas un saimnieka inficētspējas aprakstīšana, virionu stabilitātes noteikšana mainīgos vides apstākļos, fāgu pilna genoma sekvenēšana un funkcionālā anotēšana, kā arī citas eksperimentālās darbības. Fāga JELG-KS1 anotētais pilnais genoms ievietots GenBank datubāzē ar nosaukumu “Aeromonas phage JELG-KS1” un tam piešķirts piekļuves numurs ON604651.

This work describes the isolation and characterization of novel bacteriophages of Aeromonas salmonicida subsp. salmonicida strain JK, which was isolated from the sewage of Jelgava city and identified using 16S rRNA gene sequencing. A more detailed characterization was performed on one of the phages (Aeromonas phage JELG-KS1) retrieved from the same city sewage and potentially representing not only a novel phage species but also a genus. This phage was characterized in greater detail, including a description of its life cycle, virion morphology, host infectivity, virion stability under changing environmental conditions, its complete genome sequencing and functional annotation, among others. JELG-KS1 annotated complete genome sequence was deposited to GenBank as “Aeromonas phage JELG-KS1” and was assigned an accession number ON604651.