No cilvēka fēcēm izolētas zarnu mikrobiotas anaeroba kultivēšana metformīna klātbūtnē

Abstract

Metformīns ir visbiežāk lietotais antidiabētiskās terapijas līdzeklis, taču tā darbības mehānismi zarnu traktā un tiešā ietekme uz baktērijām ir maz pētīta. Lai novērtētu metformīna klātbūtnes ietekmi uz izolētas fēču mikrobiotas augšanu, tika ievākti vesela cilvēka un T2D pacienta fēču mikrobioma paraugi, no kuriem izolētā mikrobiota tika audzēta anaerobos apstākļos metformīna klātbūtnē. Audzēšanas laikā ievāktiem paraugiem veidotas 16S rRNS gēna amplikonu bibliotēkas. Paraugus sekvencēja izmantojot MiSeq Illumina sekvenatoru. Rezultātu analīzē salīdzināti paraugi, kas auguši barotnēs ar dažādām metformīna koncentrācijām un barotnēs bez metformīna. Iegūtie rezultāti liecina, ka metformīna klātbūtne barotnē, audzējot vesela cilvēka fēču mikrobiotu inhibē Clostridium sensu stricto 1 baktēriju savairošanos, savukārt, metformīns koncentrācijā 40,6 mM stimulē Escherichia-Shigella ģints baktēriju augšanu, audzējot T2D pacienta mikrobiotu.

Metformin is the most commonly used antidiabetic therapy, but its mechanisms of action in the intestinal tract and direct effects on the bacteria remain poorly understood. To evaluate the effect of the presence of metformin on the growth of isolated fecal microbiota, samples of the fecal microbiome of a healthy individual and a T2D patient were collected. Microbiota, isolated from those samples, was grown under anaerobic conditions in the presence of metformin. 16S rRNA gene amplicon libraries were created for samples collected during cultivation. Libraries were sequenced using a MiSeq Illumina sequencer. The analysis of the results compared samples grown in media with different concentrations of metformin and in media without metformin. The obtained results show that the presence of metformin in the medium when growing the fecal microbiota of a healthy individual inhibits the growth of Clostridium sensu stricto 1 bacteria, while metformin at a concentration of 40.6 mM stimulates the growth of bacteria of the genus Escherichia-Shigella when growing the microbiota of a T2D patient.