Hipofīzes neiroendokrīno audzēju pacientu metagenoma analīze

Abstract

Somatostatīna analogi SSA ir galvenā izvēle hipofīzes neiroendokrīno audzēju medikamentozajā terapijā. Pacientiem, kuri lieto SSA terapiju bieži ir sūdzības par gastrointestinālā trakta darbības traucējumiem. Pašlaik nav pētījumu par to, kā SSA terapija ietekmē PitNET pacientu mikrobioma sastāvu un funkcijas. SSA terapijas laikā tika ievākti fēču paraugi no pacientiem trīs laika punktos. Maģistra darba ietvaros veikta shotgun lielapjoma paralēlā sekvecēšana un raksturotas vispārīgās PitNET pacientu zarnu metagenoma taksonomiskās un funkcionās atšķirības. Iegūtie rezultāti liecina, ka pastāv būtiskas atšķirības zarnu mikrobioma funkcionalitātē visām pacientu grupām. Pacientiem ar SSA terapiju raksturīgas Akkermansia muciniphila un Prevotella copri relatīvā īpatsvara izmaiņas terapijas laikā.

Somatostatin analogues are the main choice in the drug therapy of pituitary neuroendocrine tumors. Patients often have complaints about disorders of the gastrointestinal tract. There are currently no studies on how somatostatin analogue therapy affects the composition and function of the microbiome in PitNET patients. During SSA therapy fecal samples were collected from patients at three time points. As part of the Master's thesis, shotgun massive parallel sequencing was performed and the general taxonomic and functional differences of the intestinal metagenome of PitNET patients were characterized. The obtained results show that there are significant differences in the functional gut microbiome of the patient group. The abundance of Akkermansia muciniphila and Prevotella coprimenta in patients treated with SSA changes during therapy.