Ar vējauzas (avena fatua) un parastās gaiļsāres (echinochloa crus-galli) sēklām saistīto sēņu sabiedrību daudzveidības raksturojums

Abstract

Šī darba ietvaros ar molekulārās bioloģijas metodēm tika noteikta ar vējauzas un parastās gaiļsāres sēklām saistīto sēņu sabiedrību daudzveidība. Noteikšana notika izolējot mikroorganismus no sēklām un iesējot tos tīrkultūrās, kā arī izmantojot sēklu noskalojumus un pašas sēklas, lai izdalītu mikrobiālo un genomisko DNS. Iegūto endofītu un epifītu sēņu izolātu taksanomisko piederību noteica izmantojot Sangera sekvencēšanas metodi, bet sēklu noskalojumu un pašu sēklu taksanomisko piederību noteica izmantojot NGS metodi. Vislielākā sēņu daudzveidība identificēta izmantojot NGS metodi ir ar gaiļsāres saistīto sēņu daudzveidība, kur starp paraugiem ir lielāka endofītu daudzveidība, bet izmantojot Sangera sekvencēšanas metodi starp vējauzas un gaiļsāres izolātiem ir aptuveni vienāda daudzveidība.

Within the scope of this work, the diversity of the fungal communities associated with the seeds of the common wild oat and cockspur grass was determined by molecular biology methods. Detection was done by isolating microorganisms from seeds and inoculating them in pure cultures, and seed rinse and seeds themselves to isolate microbial and genomic DNA. The taxonomic affiliation of the obtained endophytic and epiphytic fungal isolates was determined using the Sanger sequencing method, while the taxonomic affiliation of the seed rinse and the seeds themselves was determined using the NGS method. The greatest diversity of fungi identified using the NGS method is the fungi associated with cockspur grass where there is a greater diversity of engophytes among the samples, but using the Sanger sequencing method, there is approximately the same amount of diversity between the isolates of common wild oat and cockspur grass.