Kolorektālā vēža šūnu eksosomu proteīnu analīze

Abstract

Eksosomas ir mazas ekstracelulāras vezīkulas, kuras atrodamas praktiski jebkurās eikariotiskajās šūnās un ķermeņa šķidrumos. Tās varētu izmantot kā vēža biomarķerus, ja no vēža šūnām izdalītās eksosomās atrastu specifiskus proteīnus vai mRNS. Darba mērķis bija raksturot no cilvēka taisnās zarnas vēža šūnām (SW480) un metastātiskajām (SW620) izdalītu eksosomu bioķīmisko profilu, audzējot šūnas hipoksijas un normoksijas apstākļos. Rezultāti rāda, ka SW480 un SW620 šūnu līniju eksosomu proteīnu profils ir līdzīgs 2015. gada eksperimentā izdalītajām eksosomām, bet ar mazāku proteīnu saturu. Neatšķiras hipoksijas efekti totālo proteīnu profilā, bet virsmas proteīnu profilā novēro hipoksijas izraisītu proteīnu joslu parādīšanos hromatogrammās. Tika atrasts, ka hipoksija izraisa vēl neatšifrētu proteīnu ekspresiju eksosomās.

Exosomes are small extracellular vesicles that can be found practically anywhere in eukaryotic cells and body fluids. They could be used as cancer biomarkers if one can find a specific protein or mRNA in the cancer cells released exosomes. The aim of the master thesis was to characterize protein profile of the exosomes oobtained from human colorectal cancer cells (SW480) and metastatic cells (SW620) grown in hypoxia and normoxia. The results show the protein profile of SW480 and SW620 cell line exosomes is similar to the that obtained in 2015 experiment; however, with a lower protein content. We did not find hypoxia-induced effects on total protein profile, but in the protein profile of surface proteins we observed hypoxia-induced protein band appearance in corresponding chromatograms. It was concluded that hypoxia causes appearance of some up to now uncoded proteins in the exosomes.