Pret malārijas Plasmodium falciparum laktātdehidrogenāzi specifisku aptamēru atlase

Abstract

Malārija ir smaga un potenciāli dzīvībai bīstama infekcioza slimība. Tās precīzai, efektīvai un laicīgai diagnostikai ir ļoti liela nozīme, lai pēc iespējas ātrāk uzsāktu ārstēšanu. Pasaules Veselības organizācijas globālā tehniskā stratēģija malārijas ierobežošanai ir līdz 2030. gadam samazināt malārijas saslimstību un mirstību par 90% visā pasaulē. Viens no potenciālajiem veidiem, kā diagnosticēt malāriju ir ātrās diagnostikas testi, kuros ir iespējams iestrādāt aptamērus izveidojot ļoti jutīgus diagnostikas rīkus – aptasensorus. Šajā darbā veicām aptamēru atlasi ar proteīnu-SELEX metodi, izmantojot rekombinēto malārijas parazīta Plasmodium falciparum laktātdehidrogenāzes proteīnu. Veicot proteīnu-SELEX un sekvencēšanu tika atlasītas četras aptamēru sekveces, kuru specifiskums tika pārbaudīts ar ELONA metodi, lai noteiktu vai tās ir spējīgas saistīties ar malārijas Plasmodium falciparum laktātdehidrogenāzi.

Malaria is a severe and potentially life-threatening infectious disease. Accurate, effective, and timely diagnosis is very important to initiate treatment as quickly as possible. The World Health Organization's global technical strategy to limit malaria aims to reduce malaria morbidity and mortality by 90% worldwide by 2030. One of the potential ways to diagnose malaria is through rapid diagnostic tests, which can incorporate aptamers to create highly sensitive diagnostic tools - aptasensors. In this work, we performed aptamer selection using the protein-SELEX method, using the recombinant malaria parasite protein Plasmodium falciparum lactate dehydrogenase. By performing protein-SELEX and sequencing, four aptamer sequences were selected, and their specificity was tested using the ELONA method to determine whether they are capable of binding specifically to the malaria parasite Plasmodium falciparum lactate dehydrogenase.